Gli scopi de CISSC definiti all’atto dell’istituzione sono i seguenti:
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promuovere all’interno dell’Università di Pisa la nascita e lo sviluppo di ricerche interdisciplinari nel campo dei Sistemi Complessi;
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organizzare momenti di incontro e di scambio di idee (convegni, workshop, scuole, seminari) tra le persone che all’interno o all’esterno dell’Università di Pisa affrontano tematiche attinenti ai Sistemi Complessi;
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effettuare corsi interdisciplinari, inerenti alle tematiche dei Sistemi Complessi, indirizzati agli studenti degli ultimi anni di vari corsi di laurea e degli studenti dei corsi di dottorato;
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collaborare con centri italiani ed internazionali che perseguono finalità analoghe;
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promuovere la diffusione delle conoscenze acquisite ed elaborate.